A Tecnologia GeneChip® da Affymetrix permite
a análise quer de RNA (expressão genética) quer de DNA
(genotipagem, resequenciação).
A elevada densidade de sondas no GeneChip® array, a elevada
reprodutibilidade e a pequena quantidade de material biológico necessário
são as grandes vantagens deste tipo de tecnologia, face a outros sistemas
alternativos de microarrays.
A produção dos GeneChip®
arrays envolve os processos de fotolitografia e química combinatorial
que são usados para sintetizar milhões de cópias dos
oligonucleótidos seleccionados (com 25 nucleótidos de comprimentos
final). Neste processo, centenas de milhar de diferentes sondas são
sintetizadas, base após base, numa superfície de vidro. Cada
célula do Chip contendo uma determinada sonda tem somente um tamanho
de 11 µm x 11 µm, isto no mais recente formato dos GeneChip®
arrays.